fa بیان فاکتور سلول بنیادی نوترکیب متصل به زیپ‌لوسین بيوتكنولوژي Biotechnology پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-weight:normal;"><span style="font-family:Jadid;">چکید</span></span><span style="font-weight:normal;"><span style="font-family:Jadid;">ه</span></span><span style="font-weight:normal;"><span style="font-family:Jadid;"></span></span><br> <strong><em><span style="font-family:Titr;"><span style="font-size:9.0pt;">سابقه و هدف </span></span></em></strong><br> <strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">فاکتور سلول بنیادی، یک سیتوکاین خونی است که از طریق تأثیر بر روی سلول‌های خونساز در تمایز سلول‌های پیش‌ساز خونی، بقا، تکثیر و تمایز ماست‌سل و هم‌چنین افزایش تکثیر و تهاجم سلول‌های توموری نقش ایفا می‌کند.</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">زیپ ‌لوسین به صورت نوترکیب یا طبیعی با تشکیل همودایمر در ساختار خود، باعث همو و یا هترو دایمریزاسیون انواع بسیاری از پروتئین‌های متصل به خود شده و می‌تواند اثری مطلوب در عملکرد یا پایداری آن‌ها داشته باشد. مطالعه انجام شده سعی در دایمریزاسیون فاکتور سلول‌های بنیادی نوترکیب و زیپ‌لوسین و بیان آن دارد. </span></span></strong><br> <strong><em><span style="font-family:Titr;"><span style="font-size:9.0pt;">مواد و روش‌ها</span></span></em></strong><br> <strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">مطالعه حاضر از نوع تجربی بود. شامل بخش طراحی پروتئین نوترکیب توسط نرم‌افزارهای بیوانفورماتیک و</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">بخش آزمایشگاهی می‌باشد. شاخص‌های مورد توجه در بخش طراحی از جمله ساختارهای پروتئینی توسط نرم‌افزارهای مختلف شامل</span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;"> PSIpred </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">و</span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;">Chimera </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">&nbsp;و پایداری پروتئین نوترکیب توسط </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;">RAMPAGE</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;"> بررسی شد. پس از تعیین جایگاه‌های برش آنزیمی توسط </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;">NEBcutter</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;"> و بهینه‌سازی برای باکتری اریگامی توسط </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;">Optimizer</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;"> ، ساخت توالی انجام شد. در ادامه کلون آن در باکتری </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;">TOP10</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;"> و بیان پروتئین در باکتری اریگامی انجام گرفت.</span></span></strong><br> <strong><em><span style="font-family:Titr;"><span style="font-size:9.0pt;">یافته‌ها</span></span></em></strong><br> <strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">نتایج حاصل از مطالعه‌های بیوانفورماتیک روی پروتئین نوترکیب </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;">Leucine Zipper / SCF</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">، در برگیرنده شاخص‌های لازم جهت ساختار صحیح پروتئین و دارای امتیازی بالا از لحاظ پایداری در سلول زنده بود و در ادامه نتایج حاصل از بخش تجربی نشان از کلون و بیان موفق آن داشت.</span></span></strong><br> <strong><em><span style="font-family:Titr;"><span style="font-size:9.0pt;">نتیجه گیری</span></span></em></strong><br> <strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;">نتایج این مطالعه، همسانه‌سازی و بیان موفق پروتئین نوترکیب </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;">Leucine Zipper/SCF</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 Lotus;"><span style="font-size:11.0pt;"> در میزبان اریگامی را تائید نمود. </span></span></strong></div> <div dir="rtl" style="text-align: left;"><strong>Abstract</strong><br> <strong><em>Background and Objectives</em></strong><br> Stem cell factor (SCF) is a blood cytokine that plays an important role in the differentiation of hematopoietic progenitor cells, as well as survival, proliferation, and differentiation of mast cells. Furthermore, it can enhance tumor cell proliferation and invasion. Recombinant or natural form of leucine zipper can cause homo- or heterodimerization of many types of proteins which are attached to it and have a favorable effect on their function or stability. The present study investigates the expression of leucine zipper-bound SCF.<br> &nbsp;<br> <strong><em>Materials and Methods</em></strong><br> This experimental study consists of designing a recombinant protein by bioinformatic softwares and the laboratory part of the study. The indices of interest for designing of the protein structures were analysed by various softwares including PSIpred and Chimera and the recombinant protein stability by RAMPAGE. The sequence synthesis was performed after determination of the enzymatic cleavage sites with NEBcutter. Then, codon optimization for Origami was done with Optimizer. Cloning in TOP10 and the protein expression in Origami were performed.<br> &nbsp;<br> <strong><em>Results</em></strong><br> The results of bioinformatics studies on the Leucine Zipper/SCF recombinant protein included the necessary criteria for the possible native structure of the protein and the high score for viability in the living cell. Furthermore, the results of the experimental section showed successful cloning and expression.<br> &nbsp;<br> <strong><em>Conclusions&nbsp; </em></strong><br> In the present study, the results indicated the successful cloning and expression of the recombinant Leucine Zipper/SCF protein.<br> &nbsp;</div> کلمات کلیدی: Stem Cell Factor, Leucine Zipper, پروتئین نوترکیب, دایمریزاسیون Key words: Stem Cell Factor, Leucine Zippers, Recombinant Proteins, Dimerization 269 278 http://bloodjournal.ir/browse.php?a_code=A-10-980-1&slc_lang=fa&sid=1 F. Taghikhani فاطمه تقی خانی 9100319475328460023532 9100319475328460023532 Yes مرکز تحقیقات انتقال خون ـ مؤسسه عالی آموزشی و پژوهشی طب انتقال خون M. Mohammadipour مهشید محمدی پور 9100319475328460023533 9100319475328460023533 No استادیار مرکز تحقیقات انتقال خون ـ مؤسسه عالی آموزشی و پژوهشی طب انتقال خون K. Mousavi Hosseini کامران موسوی حسینی 9100319475328460023534 9100319475328460023534 No دانشیار مرکز تحقیقات انتقال خون ـ مؤسسه عالی آموزشی و پژوهشی طب انتقال خون