fa کلونینگ ژن POL ویروس HIV-1 و تعیین زیر گروه‌های آن ويروس شناسي Virology پژوهشي Research <p>  چکید ه </p><p> <strong><i> سابقه و هدف </i></strong></p><p> <strong> شناسایی تنوع ژنتیکی و سیر تکاملی ویروس </strong><strong>HIV </strong><strong>در کشور، به بررسی مولکولی پیوسته و مداوم نیاز دارد که بتواند اطلاعات مفیدی در راستای طراحی روش‌های درمانی و تشخیصی جدید ارایه دهد. در این مطالعه از روش ژن کلونینگ، جهت ارزیابی توزیع و تنوع ژنتیکی اشکال در حال گردش ویروس </strong><strong>HIV-1 </strong><strong>استفاده شد. </strong></p><p> <strong><i> مواد و روش‌ها </i></strong><strong></strong></p><p> <strong> در یک مطالعه تجربی، 50 نمونه که با روش الایزا، </strong><strong>HIV </strong><strong>مثبت بودند، بررسی شدند، </strong><strong></strong><strong>تمام موارد معتاد تزریقی بوده و سابقه درمان آنتی رتروویرال نداشتند. </strong><strong></strong><strong>ژن ریورس ترانس‌کریپتاز ویروس </strong><strong>HIV-1 </strong><strong>با روش </strong><strong>Nested RT- PCR </strong><strong>و </strong><strong></strong><strong>با </strong><strong></strong><strong>استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شد، </strong><strong></strong><strong>سپس با استفاده از وکتور </strong><strong>PTZ-57RT </strong><strong>کلون شد و چندین کلون از هر بیمار تعیین توالی شد. </strong><strong></strong><strong>توالی‌های به دست آمده از ژن ریورس ترانس‌کریپتاز با توالی‌های رفرانس که از بانک اطلاعات جهانی به دست آمده بود، با استفاده از نرم‌افزار 8/1 </strong><strong>ClustalW </strong><strong>مرتب شد. سپس درخت فیلوژنتیک با استفاده از نرم‌افزار </strong><strong>NJplot </strong><strong>رسم شد. </strong></p><p> <strong><i> یافته‌ها </i></strong></p><p> <strong> از 50 نمونه مورد بررسی، 30 نمونه با استفاده از روش </strong><strong>Nested RT-PCR </strong><strong>تکثیر شدند، </strong><strong></strong><strong>آنالیز نوکلئوتیدها بر روی ژن ریورس ترانس‌کریپتاز با استفاده از چندین کلون از هر فرد انجام شد. تمام نمونه‌ها ساب‌تایپ </strong><strong>CRF35-AD </strong><strong>بودند. </strong></p><p> <strong><i> نتیجه گیری </i></strong></p><p> <strong> نتایج این مطالعه نشان داد که </strong><strong>CRF35-AD </strong><strong>، شایع‌ترین تحت گونه نوترکیب در بین بیماران است. اطلاعات پیرامون تنوع ژنتیکی ویروس در افراد و ساب‌تایپ‌های ویروسی در گردش جامعه، می‌تواند در طراحی روش‌های تشخیصی، برنامه‌های کنترل عفونت و درمان، مفید باشد. </strong></p><p>  </p> <p> <strong> Abstract </strong><strong></strong></p><p> <strong><i>Background and Objectives</i></strong></p><p> The identification of the genetic diversity and evolution of HIV-1 in the country needs constant molecular survey which could represent useful information to design new diagnostic and therapeutic strategies. Gene cloning strategy was used to evaluate the distribution and genetic diversity of the HIV-1 circulating forms<strong>.</strong></p><p>  </p><p> <strong><i>Materials and Methods</i></strong></p><p> Overal, 50 HIV-1 seropositive subjects were enrolled in the study. All of them were IDUs and had no history of antiretroviral therapy. The reverse-transcriptase genes of HIV-1 were amplified by nested RT-PCR using specific primers. Then, the RT gene of HIV-1 was cloned into a cloning vector PTZ-57R. Multiple clones from each patient were sequenced. The obtained sequences were aligned with the reference sequences, retrieved from the GenBank database. Multiple sequence alignments were performed by using the ClustalW 1.8 software package. Phylogenetic trees were generated by using the neighbor-joining plot.</p><p> <strong><i> </i></strong></p><p> <strong><i>Results</i></strong></p><p> Of 50 serum samples, 30 were HIV RNA positive by nested RT-PCR. The nucleotide sequence analysis was performed on the RT genes from multiple clones. All samples were of HIV-1 CRF35-AD strains. </p><p>  </p><p> <strong><i>Conclusions</i></strong></p><p> Data showed that CRF35-AD strain is the most prevalent in HIV infected patients. Information on the genetic diversity of viruses in patients and also viruses circulating in the community can be useful in design of diagnostic procedure, infection control programs and treatment.</p><p> <strong><i> </i></strong></p><p>   </p> کلمات کلیدی : HIV1 , کلونی‌ها, تنوع ژنتیکی Key words : HIV-1, Clones, Genetic Diversity 281 289 http://bloodjournal.ir/browse.php?a_code=A-10-53-5&slc_lang=fa&sid=1 R. Tabar Asal Laleh رعنا تبار اسد لاله 910031947532846009635 910031947532846009635 No مرکز تحقیقات انتقال خون ـ مؤسسه عالی آموزشی و پژوهشی طب انتقال خون Z. Sharifi زهره شریفی z.sharifi@ibto.ir 910031947532846009636 910031947532846009636 Yes دانشیار مرکز تحقیقات انتقال خون ـ مؤسسه عالی آموزشی و پژوهشی طب انتقال خون ـ تهران A. Gharehbaghian احمد قره‌باغیان 910031947532846009637 910031947532846009637 No دانشیار دانشکده پیراپزشکی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی